Análisis poblaciones neuronales Hcrt+ y Pmch+ hipotalámicas mediante transcriptómica espacial

Este proyecto, desarrollado como Trabajo de Fin de Máster en colaboración con el Instituto Cajal (CSIC), se centró en el desarrollo de un pipeline bioinformático para el análisis de datos de transcriptómica espacial enfocados en la región hipotalámica del cerebro de ratón.

El objetivo fue identificar y caracterizar las poblaciones neuronales Hcrt+, Pmch+ y Hcrt+Pmch+, claves en la regulación del ciclo sueño-vigilia, utilizando datos del estudio “The molecular cytoarchitecture of the adult mouse brain” (Nature, 2023).

Se aplicaron técnicas avanzadas como la integración con datos de scRNA-seq y la deconvolución con el algoritmo RCTD, permitiendo resolver el solapamiento de transcriptomas en regiones densamente pobladas como el hipotálamo. Los resultados permitieron mapear con precisión la distribución espacial de estas poblaciones y revelar genes diferencialmente expresados entre ellas.

Este trabajo no solo contribuye a la comprensión funcional del hipotálamo, sino que establece una base metodológica sólida para futuras investigaciones en neurociencia y trastornos del sueño como la narcolepsia.