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Obtención de genes marcadores del BO mediante el uso de la transcriptómica espacial
Ubicación
Instituto Cajal – CSIC (Madrid)
Fecha
Julio 2023
Durante este proyecto, llevado a cabo como parte de mi Trabajo de Fin de Grado en colaboración con el Instituto Cajal (CSIC), utilicé tecnologías de transcriptómica espacial para generar un mapa de expresión génica del bulbo olfatorio (BO) de ratón.
El objetivo principal fue identificar genes marcadores que definieran las distintas poblaciones neuronales localizadas en la zona glomerular del BO, una región clave en el procesamiento olfativo, caracterizada por su complejidad estructural y funcional. Para ello, se emplearon datos públicos y herramientas de análisis bioinformático como son Seurat, DESeq2 y ClusterProfiler.
El análisis permitió:
Generar un mapa transcriptómico detallado del BO.
Definir poblaciones celulares mediante clusterización basada en perfiles de expresión.
Obtener y optimizar una lista de genes marcadores para los clusters seleccionados, asociándolos a funciones neuronales específicas.
Este proyecto no solo me permitió aplicar técnicas bioinformáticas avanzadas, sino también comprender el enorme potencial de la transcriptómica espacial para caracterizar regiones cerebrales complejas.